纵差保护主要是用来反应变压器绕组及其他套管、引出线上的相间短路，同时也可以反应变压器绕组匝间短路及中性点直接接地系统侧绕组、套管、引出线的单相接地短路。而差动保护主要用来保护双绕组或三相绕组变压器的绕组内部及其引出线上发生的各种相间短路故障，同时也可以用来保护变压器单相匝间短路故障。

纵联差动保护与横差保护的区别

1、纵联差动保护与横差保护是否具有选择性

纵联保护，是将两端的电气量比较，以判断故障在本线路范围内还是在线路范围外，从而决定是否切断被保护线路。因此，理论上这种纵联保护具有绝对的选择性。而横差保护没有。

2、纵联差动保护与横差保护地点不同

横联差动方向保护反应的是平行线路的内部故障，而不反应平行线路的外部故障。 而纵联差不少是。

3、纵联差动保护与横差保护的使用范围不同

发电机纵连差动保护的范围是发电机定子线圈相间短路的主保护，所有发电机都必须安装此保护。而发电机横差保护只有在发电机绕组为双星形或多星形接线时才会采用。

4、在阻抗相同的两条平行线路上可装设横联差动方向保护。横联差动方向保护反应的是平行线路的内部故障，而不反应平行线路的外部故障。

5、纵联差动保护安装于变压器的高低、压侧（或组合继电器的线分别接高、低压侧的保护CT回路），根据输入、输出功率相等原理（要修正空载损失），监测变压器运行状况。一旦两侧被监测数据异常达到整定值，即保护装置即动作开关，将变压器从系统切除。横差保护不是。