40年产权的商铺到期可以办理续期手续，缴纳续期费用。住宅建设用地使用权期限届满的，自动续期，续期的费用根据当地的具体规定；非住宅建设用地的使用权期限届满的，有约定的按约定，无约定的按照法律或行政法规处理。商铺40年产权属于非住宅用地，不能自动续期。

商住房40年产权到了之后怎么办？

40年产权的房子到期的是土地使用权，房子一直都是户主的。到期后房主不想使用或者继承，国家收回。房主想继续使用需申请延长土地使用期并补缴出让金。如房主想继续使用但国家不批准，那么国家回收土地并作出相应的补偿。40年产权房子土地使用者向土地管理部门提交续期申请书，除根据社会公共利益需要收回的，应当予以批准。获得批准续期的，重新签订土地有偿使用合同，支付土地有偿使用费。这样，40年产权房子所有权便得以延续。当然，变成危房强制拆除的除外。